入居時の鍵を無くしてしまいました

通常は退去時に鍵の取替費用を請求（敷金から相殺）されます。

通常は契約書に鍵の紛失についての対応等が記載されていますのでご確認ください。

但し、本来は鍵を無くした時に貸主に連絡する旨の約束になっている場合が多いです。